La Chiesa di Santa Margherita, situata nella piazza storica della borgata accanto al complesso scolastico, fu costruita la prima volta nel 1960; tuttavia, a causa di problemi strutturali riscontrati nel campanile, venne abbattuta nel 1985-86 e ne fu costruita un’altra, consacrata nel 1996. L’edificio, realizzato con linee semplici e armoniose, presenta un corpo centrale a tre navate e due cappelle laterali, con un arredamento sobrio. All’interno si trovano il tabernacolo in bronzo, realizzato con fusione a cera espansa dai fratelli Cotza, il grande mosaico di Santa Margherita con tutti i riferimenti della sua storia e la “Via Crucis”, realizzata con la pietra sarda verde di Gonare dal pittore-scultore Angelo Manca. La borgata di S. Margherita nasce con la riforma agraria degli anni ’50, avviata nel Comune di Pula dall’ETFAS (Ente Trasformazione Fondiaria Agraria Sardegna).